Wenn wir nach der Geschichte von Isla Cristina fragen, müssen wir zurück ins 18. Jahrhundert blicken, also in eine nicht allzu weit zurückliegende Zeit, die aber durchaus von grosser Bedeutung war. Die Gründung von Isla Cristina geht auf Fischer von der spanischen Levante Küste und aus Katalonien zurück, die hierher kamen, um in der Fischerei, beim Einsalzen des Tunfisches und der Sardinen zu arbeiten.

Der Salzfisch war der Ursprung der heutigen Fischindustrie in der Region und ist auch weiterhin wichtig für die Wirtschaft von Isla Cristina. Das grosse Erdbeben von Lissabon 1755 hinterliess seine Spuren in dem Ort und verwandelte die Umgebung deutlich. So entstand das heutige Bild von Isla Cristina, das einst Real Isla de la Higuerita hiess.

Ab 1834 trägt Real Isla de la Higuerita seinen jetzigen Namen Isla Cristina, ein Zeichen des Dankes für die Hilfe der Königin Maria Cristina während einer Cholera Epedemie.

Weitere wichtige Ereignisse neben der Gründung von Isla Cristina waren zum Beispiel das Erdbeben von Huelva 1969 oder die Errichtung einiger seiner wichtigsten Sehenswürdigkeiten, darunter der Kirche Iglesia de Nuestra Señora de los Dolores.